Emma Watson Paris, Fransa doğumlu İngiliz avukat olan Jacqueline Luesby ve Chris Watson'ın kızıdır. Watson 5 yaşına kadar Fransız büyükannesiyle Paris'te yaşamıştır. Daha sonra anne babası boşandığı için kendisinden 3 yaş küçük erkek kardeşi Alex ile annesinin yanına Oxford'a taşınmıştır.Bir röpörtajında Alex'in de Harry Potter filmlerinde oynamasını istediğini belirtmiştir.
6 yaşına geldiğinde aktris olmayı arzulamıştır. 10 yaşına geldiğinde okulda Mutlu Prenses, Alice Harikalar Diyarında ve Arthur: Gençlik Yılları oyunlarında oynamıştır. Buna karşın Emma'nın Hermione Granger olarak Harry Potter filmlerine seçilene kadar hiçbir profesyonel oyunculuğu olmadı. 2007 yılında Parade dergisine verdiği röportajda Film serisinin hangi ölçüde olduğu hakkında fikrim yoktu demiştir.